《口袋妖精》在傳統的三消玩法上做了創新。方法則是以橫豎方向,一次可以拉動一排寶石,連續拉動3次為一回合。一回合結束後,累積的相連寶石再開始做消除。利用消除的該顏色寶石促發同類顏色的寵物對敵方寵物發動攻擊。
在寶石相連方式上,規則也有所修改。寶石可相連成任意形狀,而不僅僅是直線連接。一次消除越多,造成的傷害/回復越高,而《口袋妖精》的寶石三消規則將消除更多的寶石,更容易產生十幾次乃至幾十次的combo連擊,傷害加成輸出更高,玩起來更爽快。
怪物對玩家攻擊時傷害是固定的,只會受到一些減傷技能的影響,這和玩家所帶寵物的屬性無關。因此提升存活能力的方法是選擇HP高的寵物,或是讓有防禦性隊長技能的寵物做隊長。