劇情簡介

オレンジ諸島を旅するサトシたちの船がはげしい潮に流されてしまう。漂着したのは＜アーシア島＞。そこで島の少女「フルーラ」から古い言い伝えを聞かされる｡サトシは言い伝えにある「すぐれたあやつり人」ではないかと思われ、3つの島から3つのお宝を持ちかえる役目をおわされる。
そんな中、謎のコレクター「ジラルダン」が、火の神といわれる「特別なファイヤー」をゲットしてしまう。それが原因で自然界のバランスはくずれ、世界は天変地異にみまわれる。ついには「ファイヤー」「サンダ－」「フリーザー」の壮絶なバトルを引き起こすことに｡サトシもバトルに巻き込まれていく。絶体絶命の時に幻のポケモン「ルギア」が現れた。ルギアは敵か味方か？サトシたちは世界を救うことができるのか！？
この星に住むさまざまなものの共生を描き、見るたびにあらたな感動や発見がある壮大なポケモンワールド！