在《惡靈古堡》發售後，由於大受歡迎，三上真司立即開始《惡靈古堡2》的開發工作，並且定於1997年3月發售。同時卡普空表示《惡靈古堡2》將會同時在Playstation及SEGA Saturn平台上開發。

在1998年，最終版本的《惡靈古堡2》在PlayStation平台上率先發售，取得空前的成功。但是《惡靈古堡2》在Sega Saturn上的開發工作被中止，暫定改為在SEGA的後繼機種之上發售。

卡普空曾經有意將《惡靈古堡2》移植至GBA和NDS平台，但在一些DEMO影片流出之後就再也沒有訊息。

故事分為兩條劇情線： 里昂線（Leon Scott Kennedy）和克蕾兒線（Claire Redfield）。

依照破關的先後順序，故事會有少許不同，但是大體故事構架是一樣的。

1998年9月29日，新人警官里昂（Leon Scott Kennedy）來到拉昆市（Raccoon City）警察局上任。但是，在進入市區以後卻遭遇了被T病毒（T-Virus）感染的喪屍。 同一時刻，S.T.A.R.S.隊員克里斯（Chris Redfield）的妹妹克萊兒（Claire Redfield），為了尋找失去音訊的哥哥也來到了拉昆市，並且也遭遇了殭屍，正是因此，兩人陰錯陽差的相遇了。相遇後，兩人計劃結伴去拉昆市警察局（S.T.A.R.S.小隊的辦公室位於警察局2樓），但在路途中卻遭遇了車禍，兩人被爆炸的油罐車所引燃的火災分開了。兩人在火焰的兩邊約定：各自找到去警察局的路，然後在那裡碰頭，於是，遊戲的雙劇情線由此展開……

惡靈古堡1.5

惡靈古堡1.5或稱惡靈古堡2原型，是惡靈古堡2最早開發的版本，這是遊戲愛好者的叫法。因為三上真司認為這個版本的惡靈古堡2與惡靈古堡1過分相似，在即將完成開發的時候被放棄，推倒重來。人物除女主角被更換之外，大部分的人物都有所保留。官方在惡靈古堡1導演剪輯版中將這個版本的遊戲影像公開。惡靈古堡1.5已經完成了全部關卡的開發，網路已流出惡靈古堡1.5的完整遊戲流程影像，此外還有部分圖片是整個遊戲中後期的截圖。然而遊戲沒有CG動畫、音樂、人聲等，衹有部分聲效。受到惡靈古堡2大受好評的影響，惡靈古堡1.5同時被上一層神秘色彩，至今仍使惡靈古堡迷熱衷於尋找此遊戲的測試版。