跨越千年這款遊戲的佈陣為九宮格內隨意安放武將，所以武將所安放位置的精妙直接可以左右整個戰局，並且取得勝利。 
關於武將的安放位置，如圖中，將領“惡來”所在的位置那一豎行，在戰鬥中處在最前沿的位置上，該位置建議主要安放肉盾型的武將，因為最前沿的武將在戰鬥時多為被集火的物件，所以一定要前頂，給予後面輸出型的武將更多的回合數進行輸出。
再有中間一豎行中，建議放置中程普通攻型輸出的武將，可以確保穩定的輸出。這裡可以分為武力輸出型武將和策略輸出型武將，根據實戰的需要去選擇自己所需要的武將。
最後就是最左邊，也是最後排的一豎行，建議放置輔將或者技將，該類型的武將一種為輔助型，一種為技能殺傷性，輔助型為加血和加怒氣值的武將在戰場中起到支援作用，有它的存在就可以保證最前面肉盾武將的生存能力大大提升，但是因為輔助型的武將非常的皮脆，而且也是對方想要儘快除去的目標，所以放在最後面也是為了確保其安全性。技將屬於技能攻擊類型武將，多為較大範圍的技能高傷害，對於雙方都構成較大的威脅，在陣型上面也是放在後面，因為需要積攢怒氣來釋放技能，所以需要更多的生存時間，為了確保其安全也是建議放在最後面。
對於武將在陣型中的位置，沒有固定式，實際戰鬥中還需要根據實戰中敵人的位置去改變自己的位置，九宮格佈陣所帶來的效果就是戰鬥中部隊的位置比較靈活，而且變數很多，所以對於武將的選擇以及位置就變得尤為重要了。
陣型系統
